艾条燃烧时，其精油成分充分挥发，弥漫居室的每个角落，能抑制或杀灭空气中的细菌和病毒，研究表明艾烟对结核杆菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌、枯草杆菌、铜绿假单胞杆菌及霉菌等常见致病菌均具有较好的抑制作用。

有临床试验研究发现，用艾烟消毒法对门诊室内空气消毒60分钟，与紫外线消毒效果没有显著性差异，证明二者具有同样的消毒效果，但艾烟消毒法可有效避免紫外线消毒对人体刺激产生的不良反应，如胸闷、憋气等。